新型コロナウイルスのRTPCR検査の感度と特異度と精度の違いを簡単に説明してみた
2020-05-06 [記事URL]
新型コロナウイルスの蔓延を阻止するために自宅待機している皆様お疲れ様です。
補償が出るまでの我慢ですので頑張りましょう。。。
さて、今回はみんなが混乱しているであろう感度と特異度と精度の違いについて説明したいと思います。
※表などを大幅改定しました！
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ドライブスルーにおける大量のPCR検査のやり方を考察してみた
2020-04-10 [記事URL]
日本の感染者数も指数関数に乗ってしまいましたね。
日本政府もやっとドライブスルー型のPCR検査の検討を始めました。
しかしながら、現状の日本においては、ドライブスルー型のPCR検査のシステムを構築できる人がほとんどいないように思われます。
現在のPCR検査待ちは10日とからしいので、早急にシステムの再構築が必要だと思われます。
今日検査予約取れた人は23日の午後に受けられるそうで、しかし当日に症状が出てないと検査しても出ないと言われたそうですが。
なら症状出ている今やらないと意味が無いって事ですよねw— Dob lure 区民 (@yabitu) April 10, 2020
PCR検査をすると医療崩壊が起こる。早期発見しても意味がない。というデマについての考察
2020-04-03 [記事URL]
PCR検査をすると医療崩壊が起こる!
早期発見しても意味がない！
という発言をする人がいます。
例えば村中氏は
このように発言しております。
しかし、実際には韓国は医療崩壊しておりません。
また、彼女はなぜ「検査、検査、検査」なのかーPCR検査を考えるでも、PCR検査は受ける側のメリットはない。と言っております。
反対に私は、
PCR検査を受けると、その後の行動にも選択肢が広がったりするなどのたくさんのメリットがある
とブログに書いてきました。
実際のところ、何が正しくて何が間違っているのでしょう？
新型コロナウイルスの感染のしくみとお薬などについて書いてみた
2020-03-31 [記事URL]
新型コロナウイルスにより、志村けんさんがお亡くなりになりました。
著名人が亡くなったことにより、たくさんの人が新型コロナウイルスの怖さを自分の事としてとらえたと思います。
今回は、新型コロナウイルスが、どのように感染していくのか？と、いま話題となっているお薬がどうやってウイルスに効果を発揮するのか？などについて書いてみたいと思います。
巷でウワサの抗体検査キットについての解説
2020-03-26 [記事URL]
RTPCRをしたことのない人の勘違いについて書いてみた
2020-03-23 [記事URL]
PCR検査の感度は30～50％や70％だというデマの出所の論文を読んでみたで、PCR検査の感度が30％とかになる理由が、
検体採取後にRNAを壊してしまっているからだ
と説明しました。
しかしながら、未だにPCR検査＝意味がないと言っている人がたくさんいますので、その人らが勘違いしているであろうことを書いておきます。
新型コロナウイルスの収束はいつになるのか？
2020-03-20 [記事URL]
新型コロナウイルスの感染拡大が止まりません。
大阪の吉村知事は2020年3月19日の夕方、兵庫と大阪の往来を自粛するように要請を出しました。
その根拠は、
「大阪兵庫両府県では１９日までの１週間で感染者が約８０人増加した。このまま放置すれば今後の１週間（3月26日）で最悪の場合、感染者が586人に増え、さらに1週間後の4月2日には3374人に達する」
という内容の試算を国から派遣された専門家から示されたからです。
大阪知事「事態を重く受け止めた」、兵庫知事「大阪はいつも大げさ」…往来自粛
PCR検査の感度や精度は30～50％や70％だというデマの出所の論文を読んでみた
2020-03-12 [記事URL]
追記2020.3.28
感度（＝真陽性数/（真陽性数+偽陰性数））
と
特異度（＝真陰性数/（真陰性数+偽陽性数））
と
陽性的中率（式略。上記二項目+母集団の有病率で表される）
を混同してませんか？みたいなコメントがたくさん来るのですが、まったく混同しておりませんので、悪しからず。
日本におけるPCRの精度が悪いのは、RNAが壊れているからだというのは、その運搬状況や保存状況からみても明らかです。
PCRの感度についての一般人の見解
孫正義さんが
新型コロナウイルスに不安のある方々に、簡易PCR検査の機会を無償で提供したい。まずは100万人分。申込方法等、これから準備。#コロナ検査有志
とツイートしました。
新型コロナウイルスに対して、一般市民はどうしたらいいのか？を書いてみた。
2020-03-06 [記事URL]
なにを信じたらいいの？
世間は相変わらずコロナウイルスの話題でいっぱいですね。
医師や感染研、厚労省、国は信用できるのか？
テレビを見る人は、「テレビでお医者さんがこう言っていたから間違いない！」といい、ツイッターでは、「テレビに出てる医者がまたデマを流している！」といい、感染研は、「テレビでのデマに注意してください」という声明を出したりしてカヲスですね。
国立感染症研究所が「検査拡大を拒んでいる」情報を否定 メディアに向けた「お願い」も
だからと言って、国がちゃんとしているかというと、そうでもなく、医者がコロナの検査をして！と依頼してもしてなかったりするわけですね。。。
ウイルス検査依頼を保健所が拒否 ７道県で30件報告 日本医師会
もう何を信じたらいいのかわからない状態です。
なので、シンプルに、こうしたらいいんじゃないの？っていうのを書いときます。
新型コロナウイルスに関するPCR検査のあれこれを書いてみた
2020-02-29 [記事URL]
このエントリは
新型コロナウイルスの対処法とかあれこれ書いてみた
新型コロナウイルスの検査法の感度ややり方について書いてみた
ダイヤモンドプリンセス号に潜入した岩田氏の動画のあれこれを解説してみた
新型コロナウイルスの病原体検出マニュアルをチェックしてみた
の続きです。
新型コロナウイルスの病原体検出マニュアルをチェックしてみたについての質問や疑問、いちゃもんがたくさん来ていたので、私ならこうする！の部分をこのエントリに移植して解説していきたいと思います。
新型コロナウイルスの病原体検出マニュアルをチェックしてみた
2020-02-24 [記事URL]
このエントリは
新型コロナウイルスの対処法とかあれこれ書いてみた
新型コロナウイルスの検査法の感度ややり方について書いてみた
ダイヤモンドプリンセス号に潜入した岩田氏の動画のあれこれを解説してみた
の続きです。
こんばんは！
今回は、厚生省の出した病原体検出マニュアル（RTPCRのマニュアル）について書きます。
ちょっと専門的になりますし、いちいち言うのもしんどいのですが、おかしいところはおかしいと言っておかないとダメだと思うので書いておきます。
ダイヤモンドプリンセス号に潜入した岩田氏の動画のあれこれを解説してみた
2020-02-21 [記事URL]
このエントリは
新型コロナウイルスの対処法とかあれこれ書いてみた
新型コロナウイルスの検査法の感度ややり方について書いてみた
の続きです。
今回は、おこがましいのですが、2月18日にダイヤモンドプリンセス内に潜入し、船内の悲惨な状況を日本語と英語でyoutube配信した神戸大学感染症内科の岩田健太郎教授とその動画の内容について解説してみたいと思います。
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新着コメント
- iina-kobe さん：
>反論に対してスパム扱いするのは、仮にも科学に携わるものとして恥ずべきことではないでしょうか。
貴方の書き込みは科学的根拠に基づかないものですので、スパムだと申しております。>そもそも検体採取を行う部位のウイルス量が少なければ、たとえ本当の感染者に対して熟練の医師が検体採取を行ったとしても、偽陰性は免れません。
すでに論文で、どの時期にどの部位にどれくらいのウイルス量があるのかは出ておりますのでそれをふまえてやれば問題ないです。>もう少し医療現場や臨床医学についての理解を深められてはいかがでしょうか。
PCR検査の感度や精度は30～50％や70％だというデマの出所の論文を読んでみた
それは貴方にそのままお返しします。
すでに、この論文https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.05.20053355v2では、鼻腔からの検体によるRTPCR検査の陽性割合が発症日で94.39％となっております。
RTPCR検査自体の精度が90%以下であるならば、このような数字は出てこないのですよ。
もう少し精度と検査による検出率の違いについても勉強されたほうが良いかと。
ここにもあなたの陥っている勘違いについて書いております。RTPCRをしたことのない人の勘違いについて書いてみた - hun さん：
反論に対してスパム扱いするのは、仮にも科学に携わるものとして恥ずべきことではないでしょうか。
「新型コロナウイルスのRTPCR検査の感度と特異度と精度の違いを簡単に説明してみた」を読んでみました。
研究室におけるPCR検査のやり方にはお詳しいようですが、やはり「臨床検体」を用いた検査について知識が不足しておられるようです。
検体採取を行う医師や検体を扱う技師の熟練度については言及しておられますが、そもそも検体採取を行う部位のウイルス量が少なければ、たとえ本当の感染者に対して熟練の医師が検体採取を行ったとしても、偽陰性は免れません。
素人の方は、感染者の感染部位には常に多量のウイルスがいて容易に採取できると誤解されていることが多いですが、臨床においては理屈通りにいかないことが多々あります。
もう少し医療現場や臨床医学についての理解を深められてはいかがでしょうか。また、上で挙げられた感染研の資料について解説しますと、これは「検体内に一定量のウイルスが含まれているか否か判明している検体（陽性検体と陰性検体）」を対象として、複数の検査キットでPCR検査を行い、その陽性・陰性一致率（正答率といった方が分かりやすいでしょうか）を比較したものです。
PCR検査の感度や精度は30～50％や70％だというデマの出所の論文を読んでみた
つまり、これは「検査キットの感度・特異度」を調べたものであって、「検体採取～cDNA増幅」という検査全体の感度・特異度を調べたものではありません。
繰り返しになりますが、臨床検体を用いたPCR検査の感度は「検体採取」の段階に大きく依存しますので、検査キットの感度が100%であっても、PCR検査の感度が100%にはなり得ません。
なお、コンタミがない限り特異度がほぼ100%であるという点については、私も異論はありません。 - iina-kobe さん：
きちんと読んでからコメントしてください。
PCR検査の感度や精度は30～50％や70％だというデマの出所の論文を読んでみた
でないと、スパム扱いしますよ。。。
新型コロナウイルスのRTPCR検査の感度と特異度と精度の違いを簡単に説明してみた - hun さん：
https://www.niid.go.jp/niid/images/lab-manual/2019-nCoV-17-20200318.pdf
↑こちらは、異なるキット・検体処理方法間における検査結果の一致率を評価したものであって、PCR検査の感度そのものを調べたものではありませんよ。
他の方もおっしゃっていますが、臨床におけるPCR検査の感度（実測値）を規定する最も重要な要素は「感染者から採取した検体の中に検出限界以上のウイルス量が含まれているかどうか」です。
ご自身でもよくご確認ください。他の点については、誤読しないよう熟読してからまた回答いたします。
PCR検査の感度や精度は30～50％や70％だというデマの出所の論文を読んでみた - iina-kobe さん：
残念ながら実際には精度は90％以上なのですよ。
PCR検査の感度や精度は30～50％や70％だというデマの出所の論文を読んでみた
もし仮に精度が70％なら、もうそんな検査は使い物にならないのです。
現実にはたくさんの国で使用されており、精度も十分に保たれております。
きちんと勉強なされたほうが良いです。
新型コロナウイルスのRTPCR検査の感度と特異度と精度の違いを簡単に説明してみた